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作者:二十八画生审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 经常看到类似的提问:转录组测序分析中FPKM和TPM哪个归一化方法好?小编并不盲从,此前一直使用FPKM,Nature...
回顾 首先对基因表达分析(上)做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具:RNA-Seq,microarray, qRT-PCR等(欢迎补充) RNA-Seq,microar...
我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书,链接是 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/[http...
转录组学(Transcriptomics),是一门在真整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科,从RNA水平研究基因的表达情况。转录组测序是通过二代测序平台快速...
测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...
前面在讲GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin....
what is Gene Ontology ?——基因本体论 1 , 什么是本体论?简单来说,就是我们对一个具体事物进行分类并予以描述。例如:猫是一种哺乳动物/猫是猫科动物/...
转录组学习一(软件安装) 转录组学习二(数据下载) 转录组学习三(数据质控) 转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究) 转录组学习五(reads的比对与samtoo...
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lz从今天开始希望跟大家分享一些生信的实战,希望与大家一起进步,前段时间应老板的要求自学的转录组的拼接原理,经过一番折腾,最终在超算平台的帮助下完成了老板交给的任务。 ...
刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识,总能从不同角度获取一些观点,然后扩增自己的知识库,这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪,把自己认为重要的内容梳理下,用Q...
这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...