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陈实富博士编写的 fastp 软件能实现 FASTQ 数据自动化过滤、剪裁、错误校正等功能，因其多样的功能和高效的速度受到了许多用户的欢迎，已成为 NGS 质控领域不可或缺的...
徐老师，version `GLIBC_2.15' not found这个问题怎么解决0.0
使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装使用ALLHiC基于HiC数据辅助基因组组装 基因组组装大致可以分为三步（1）根据序列之间的重叠情况构建出contig，（2）基于二代的mate pair文库或光学图谱将co...
WGCNA分析中如何选择软阈值？这次依然还是给你抛出官网教程，依然是：你看还是不看，它就在那里，等着你的深入研究～ https://horvath.genetics.ucla...
分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础上，开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
群体进化概念 不同生存条件下的同一物种会因为自然选择、人工驯化、遗传漂变等形成不同的亚种或亚群，群体进化研究就是用来追溯和揭露这个进化过程的。 群体进化研究,利用全基因组或简...
提起 LTR，相信很多人和我之前一样都是熟悉又陌生的感觉，听过或者接触过却未深入了解过。若您对 LTR 分析有兴趣，却苦于无从下手时，愿本文作为一个叩门砖，为您敲开 LTR ...
在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清晰地展现出来，不少读者朋友应该...
基因家族扩张或收缩，进化树1[//www.greatytc.com/p/8c6ef557cc71?from=singlemessage] 2[https://ww...
最近刚返校，事情比较多，每天也很忙，之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）》也一直没来得及更新，缺少cafe输出结果的解读及后面的可视化。最近在简书上也收到了...
这一篇会在 从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)基础上开始在circos绘制基因密度信息。为了保证一致性，可以新建如下几个文件 circos.conf: karyotype....
一般基因组文章都会有下面这种酷炫图，用来描述基因组的基因密度分布，转座子的密度分布，和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系，以及其他各种你只要测序就能加上的信息，比如...
在从零开始学Circos绘制圈图（一）我们已经绘制出一个比较丑的circos图，这一部分是讲解一些细节。 这一部分会从上一步的两个文件开始，分别是 karyotype.tai...
催更（下）❤❤❤❤
「JCVI教程」如何绘制CNS级别的共线性图（上）本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我们先从http://plants...
本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我们先从http://plants...
@大大的世界和小小的人儿 看看文件格式对不对，tab分隔，序列名是不是对应，
「JCVI教程」如何绘制CNS级别的共线性图（上）本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我们先从http://plants...
目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...
