发简信
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刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文，当时简单做了了解，但有朋友说意犹未尽，嗯我也这么觉得，总觉得还是学的不够。推荐阅读：https://github...
偶然间翻出来了18年学习jimmy的”直播我的基因组系列“所做的一些理解，文章写于18.7.30，因为当时感觉工程浩大，所以迟迟没有发出来，但现在我想，“攒着攒着就烂了”，好...
文章，重在研究思路。有好的思路，才能有精彩的故事。很多时候，我们想找一个好点子，比如性状，疾病相关的关键分子，需要设计实验，做大量的分子筛选的工作，对于土豪实验室可以可以大把...
1. prepare-reference 如果用RSEM对比对后的bam进行转录本定量，则在比对过程中要确保比对用到的索引是由rsem-prepare-reference产生...
Bounding Box预测（Bounding box predictions） 在上一篇笔记中，你们学到了滑动窗口法的卷积实现，这个算法效率更高，但仍然存在问题，不能输出最...
作者：白介素2某同学：小张小张，我想查一下某某某，你有没有数据库给我用下呀？我: 我没有关注你这个领域哎，你要不要。。。 同学：^^^^^^（看来你生信学的也不怎么样嘛，连个...
本篇文章将给大家介绍一些宏观的核心概念和测度来评价分类算法和分类器的表现，尤其是如何评价分类器预测中会产生的一些错误。 伪阳性(False Positives)和伪阴性(Fa...
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到 Background; 做分析时，分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义的gene list。 例如，...
决策树 有的人可能听过一个词：CART，这个代表的意思是Classification And Regression Tree。它是一个分类和回归的决策树。它被分为两类，一类是...
边缘检测 卷积运算是卷积神经网络最基本的组成部分，使用边缘检测作为入门样例。在这个笔记中，你会看到卷积是如何进行运算的。 在之前的笔记中，我说过神经网络的前几层是如何检测边缘...
从图像中提取CNN特征，VGG模型是首选算法 。VGG是牛津大学Visual Geometry Group（视觉几何组）的缩写，以研究机构命名。VGG论文给出了一个非常振奋人...
SVM 可用于离散因变量的分类和连续因变量的预测，相对于单一的分类算法（Logistic、决策树、KNN。朴素贝叶斯等）有更好的预测准确率，因为它可以将低维线性不可分的空间转...
第一部分 叶绿体基因组类的文章通常会做重复序列分析，然后通过柱形图来展示不同长度重复序列的数量，通过饼图来展示重复序列位于内含子、外显子和基因间隔区的比例，以下简单记录自己利...
气候变化指数CCI通过对气象要素异常和极端天气的概率进行分析。在此基础上，从三个方面初步的选取了与气候变化密切相关的12个指标。 运用熵权法和变异系数法将指标综合到基于气候变...
