请问您操作出来了吗?这一块。
使用liftover创建注释Chain文件(基因组坐标转换)问题情形: 在自己组装出一个基因组之后,会想要看自己的序列的组装情况和染色体朝向,或者是想根据已有的基因组注释文件创建自己的基因组的注释文件。这个时候需要的是一个chain ...
请问您操作出来了吗?这一块。
使用liftover创建注释Chain文件(基因组坐标转换)问题情形: 在自己组装出一个基因组之后,会想要看自己的序列的组装情况和染色体朝向,或者是想根据已有的基因组注释文件创建自己的基因组的注释文件。这个时候需要的是一个chain ...
您好,请问这一块可以详细操作一下吗?
“另外,需要搭建parasol集群环境:
参考:http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Parasol_job_control_system
需要注意的是:文档中并未提及需要能免密ssh localhost,需要自己手动配置免密ssh本地,设置好后其余的按照文档要求做即可。”
更新于2020.10.27 二代测序方式分为三种:single read 单端测序paired-end read 双端测序mate-pair read 配对测序 虽然有三种方...
前言 “天下没有不散的筵席”~ 正如开章所说“这个年代,谁™还有人做GWAS啊?!” 也没有想到这个系列是最受欢迎的, 亲们所看到1-21章操作出来的文章,今天的状态更新了 ...
前言 今天说一下如何“上位”~ 1.大神橙子牛奶糖已经写得很清楚了,不多写: https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.ht...
前言 这年头,谁还TM的做GWAS~ 今天导师不是想和你看流星雨, 是想和你看看他感兴趣SNPs在某个亚组数据中的基因型....... 怎么办? I have 一堆SNPs,...
1、GWAS4D 网址:http://mulinlab.tmu.edu.cn/gwas4d 2、SNPnexus 网址:https://www.snp-nexus.org/i...
本人通过无数个网上文章的指导,无数个萝卜的坑,终于摸索出了一整套完整的、傻瓜式的寻找全基因组的SNP实操流程。 仅以此文纪念我这俩个月的努力。 首先获得序列。序列的这一块我是...