发简信
IP属地：宁夏
问题：由于基因组文件路径含有中文报错？OK，换成英文就没用问题了。
prefetch.3.0.2: Current preference is set to retrieve SRA Normalized For...
广告太多，
1、转录在数据比对软件STAR是ENCODE计划(ENCyclopedia Of DNA Elements,人类基因组DNA元件百科全书计划)的...
现在主流的基因组注释文件GFF3，分为9列，并用制表符分隔。1、序列名（seqname）。一般是染色ID，chr12、来源（source）。一般...
1、数据获取 转录组原始数据一般以SRA的格式存放于NCBI，并且有一个ID，如一个项目ID：PRJNA778905；单个原始数据的ID：SRP...
1、准备序列和GFF文件 过滤gff3文件awk '1}' | awk '{print 9"\t"5}' | sed 's/ID=//' > ...
随计 1、利用Pfam 查找基因家族 2、准备大蒜、洋葱、大葱的蛋白序列、CDS序列、基因组序列、GFF3文件 3、使用blast+比对或者di...
SnpEff 软件需要使用Java运行，常用的两个命令build和eff, build 用于构建数据库，eff用于对SNP/Indel 进行注释...