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批次效应除去-GEO案例分析 最近分析来自不同平台的GEO数据，GEO分析推荐学习Jimmy大神的B站视频，也可以学习我之前的教程。limma和sva两种方法进行批次效应去除...

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GSEA-analysis 1.加载数据 载入前一步分析得到的表达矩阵 2.批量相关性分析 将第一行目的基因跟其他行的编码基因批量做相关性分析，得到相关性系数以及p值。 3....

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目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...

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最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程，但是发现了几个不一样的地方，所以重新整理流程，代码主要来自原作者Juan_NF。 文...

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转自 TCGA数据下载—TCGAbiolinks包参数详解 原创 hls 组学大讲堂 2019-10-22 Install tcgabiolink if(!requireNa...