发简信
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一、流程概括 RNA-seq原始数据的质量评估 低质量测序数据的过滤和清除 过滤后数据的质量评估 reads比对基因组和转录组 计数和定量 二、...
癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类：肿瘤相关性抗原（tumor-associatied self-antigen）以及肿瘤特异性抗原（t...
安装 conda安装 普通安装 在Mac OS X上使用Homebrew或者在Linux系统上使用linuxbrew安装 将已经安装的MiXCR...
美国FDA目前批准了3个检测肿瘤TMB（ tumor mutation burden）的方法：Omisc Core WES、MSK-IMPACT...
10.1 背景介绍 现在考虑一个双色微阵列实验，其中所有的阵列都使用了通用参照。如果在整个实验中将相同的通道作为通用参照，则可以对表达值的log...
9.1 背景介绍 与早期的微阵列不同，大多数数据现在都是单通道类型。单通道数据来自流行的微阵列技术，如Affymetrix，Illumina或A...
8.1 背景介绍 limma软件包使用称为线性模型的方法来分析设计的微阵列实验。这种方法允许分析非常一般的实验，就像分析简单的重复实验一样容易。...
我们通常建议将微阵列平台上的所有探针进行标准化处理。 对于下游分析，通常需要删除那些看起来在任何实验条件下都不表达的探针。这被称为过滤。我们一般...
6.1 背景校正 默认的背景校正是从每个点的前景强度减去背景强度。如果RGList对象没有经过背景校正，那么normalizeWithinArr...