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二代测序的去重是非常重要的一步,常规的方法都是在比对到基因组之后利用基因组位置的信息来去重,这样效率比较高,但有些时候我们要在拿到测序的fast...
-cInstead of printing the alignments, only count them and print the tota...
RStudio是R语言集成开发环境的应用软件,RStudio Server是一个基于web访问的RStudio云端开发环境,需要安装在服务器上,...
ATAC-seq作为检测基因组开放位置的重要手段,被越来越多的使用。而其call peak的方法也有很多,这里我们介绍的是MACS。MACS最初...
以ChIPseq为例我们想要看某一个转录因子在所有TSS附近的信号的平均,看在一个TSS附近直接用igv打开就行,但当我们看所有TSS或者给定一...
先上网站链接,这些都不需要安装,直接下载下来就可以用,比较便捷http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/...
实验室服务器由于网络问题需要设置代理 export之后经常没用,不知道为什么,所以可以为每个命令设置代理 wget pip --user可以只为...
MACS2不知道为什么在python3里面安装了之后不能用,好像是numpy版本的问题,经检验python2.7依然可用。