批量的树文件处理,非常nice。我在批量修改基因树 id 时,碰见过 bug,不过无伤大雅。 具体请参考:[1] http://gensoft.pasteur.fr/docs...
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写在前面绘制某一基因家族的进化树,这是基因组学研究过程中不可缺少的一部分。划分成不同的基因家族的依据一般是其具有某一相同的结构域,下面我将以水稻中GUB_WAK_bind类家...
在当下互联网盛行的时代下,Python成为了一种全民都在学Python的编程语言,每天都会有前仆后继的人去学习。 相信绝大部分零基础小白学Python的时候,都会抱有这样的疑...
从gff3提取intron的坐标信息: # 提取mRNA和exon信息: awk '{if ($3 == "mRNA" ) print $0}' Homo_sapiens.G...
我有无数次想放弃继续开发 TBtools 的想法,原因种种。有时候会想得很清楚,这本来就是一个不务正业的副产品;有时候会觉得很痛苦,尤其是一些人就是不愿意在社群讨论,一定要找...
简介 Biopython项目是旨在减少计算生物学中代码重复的开源项目之一,由国际开发人员协会创建。 它包含表示生物序列和序列注释的类,并且能够读取和写入各种文件格式(FAST...
1.基因组综合研究数据库 数据库植物网址TAIR拟南芥http://www.arabidopsis.org/[http://www.arabidopsis.org/]SIGn...
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
感谢CJ大神的反复修改,这个功能越变越好了!本文旨在复现CJ大神推文内容,具体请参考“省心炸鸡”,手动狗头(//www.greatytc.com/p/b9034ce...