当只有 BAM 文件时,那么需要从下载参考基因组和注释文件开始,然后使用这些文件进行比对和注释,最终通过 velocyto 分析生成 .loom...
velocyto 的输出文件通常是 .loom 格式的文件,包含了单细胞测序数据中 premRNA 和 mRNA 的表达信息,以及细胞的速度估计...
首先介绍下各个ID的转换,比较便捷的有: 1.在线的:Uniprot : ID mapping 工具,可以批量转换和下载https://www....
ggplot的横坐标轴标签可以倾斜,不做赘述: 但是!!不好看!45°的倾斜的角度有点过头,位置上text和sticks离得太远。 经过调整和摸...
坐标轴的数字特别大,很多0,又不想改成log10的显示方式时,可以改为10的N次方。 注:此方法基础代码来源于:https://groups.g...
ggplot2在作图时,各组的排列顺序总是默认按照首字母顺序排列,如下图。但实际上,实验数据在展示时一般应对照组在左,实验组在右。 所以需要在载...
有时会遇到类似上图的情况,进行了一系列的筛选后,一条肽段对应着不同基因名,如下: 此时希望可以 : 实现上述需求的代码如下: 首先,是一个对数据...
俗话说:高端玩家自定义配色方案有时候时候总不尽如人意,想添个颜色、去个颜色或者改变一下颜色顺序,所以可以将配色方案里的颜色编码提取出来,作图的时...
基于ggplot2的绘图导出时,可以指定整张图像的大小,这里不做赘述。 本文所指绘图区是指坐标轴之间的绘图区,不含图例区,标题区,标签区。即横纵...