超保守原件UCEs,(ultraconserved elements )，是在进化过程中，各个物种保留的一种保守序列，因此可以通过提取该类序列，从而分析各个物种的进化情况，相...
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超保守原件UCEs,(ultraconserved elements )，是在进化过程中，各个物种保留的一种保守序列，因此可以通过提取该类序列，从而分析各个物种的进化情况，相...
IQ-tree也是一款最大似然法构建进化树的软件，目前IQ-tree已经更新到2.0版本功能和性能也有很大的提升，主要有四大功能，高效建树（efficient tree re...
https://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.输入文件的准备.两个文件, 一个是进...
正在更新。英文是真的看不习惯。参考：使用MAKER进行基因注释(高级篇之AUGUSTUS模型训练） - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...
1、安装maker 运行多线程时出现conda把很多linux命令都自己做了，可按照官网安装相应的gcc（https://conda.io/docs/user-guide/t...
原理参考：http://www.chenlianfu.com/?p=3084[http://www.chenlianfu.com/?p=3084]解析参考：https://u...
防杠叠甲：下述所有内容均为本人理解，欢迎友好的学术讨论。觉得看不进去的，写的不好的请windows用户移步右上角×标记，mac用户移步左上角，手机用户请关机。 持续更新中 将...
系统发育树几乎是基因家族文章的必备图，一个好看的树图的确能给文章增色不少，一般的用户可能只使用MEGA绘图，进阶一点的便会使用iTOL，evolview等2款在线绘图平台，然...
写于20201114这部分，我是进行了基因组各个组分的一些统计。详细内容如下： 01.DMR和NSR在基因组中各个组分的占比 02.基因组各个基因组成分（exon、intro...
1. perl坏了 原因描述很简单，就是说perl的东西坏了。更新环境下的perl，如果是conda安装的话，全部更新一下解决了 2. perl冲突 这个问题是因为用系统pe...
SFS的基本理解、介绍的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
ANGSD软件可以基于比对好的bam文件，提取得到与比对用的参考基因组一致性的基因组，有了一致性基因组，可以根据对应参考基因组的gff3文件提取对应的原件进行比较分析，基于二...
1.选择信号分析—Fst选择信号分析 概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群...
