IntAssoplot包可以将GWAS结果和LD, 基因结构图整合在一起画出。介绍来自:https://github.com/whweve/IntAssoPlot[https...
一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...
MR Base Overview MR Base是一个用于孟德尔随机化的在线数据库以及分析平台,由Bristol大学的MRC Integrative Epidemiology...
ImageJ处理共聚焦图片 “File” --- “Open” --- 打开文件 --- 不同特殊选择直接点击“OK” 调整亮度/对比度:“Image” --- “Adjus...
表达数量性状位点(expression quantitative trait locus, eQTL)是一类能够影响基因表达量的遗传位点(大部分都是单核苷酸多态性,SNP),...
eQTL 分析 转录组+SNP联合分析:Matrix eQTL R包 文献:Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large m...
目前针对QTL分析有很多软件,比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用Matrix eQTL进行分析。首先我们先了解一下什么...
归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
GWAS找到显著信号位点后,需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括: 1)GWAS和eQTL共定位; 2)GWAS和sQTL...
因为我自己研究的领域跨单细胞、QTL、以及孟德尔随机化,所以就一直在思考这个问题:单细胞能不能和孟德尔随机化联合起来研究? 这方面的文章或者研究比较少。两个组学能够联合我能想...