石河子大学第一附属医院泌尿外科副主任医师
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该教程分为2部分，第1部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】 到此时，原始...
从这一篇开始，是我重复一篇文献的记录，我在第五周文献学习笔记中提到过。 1. 过滤adapter 在第二篇笔记中，我判断接头序列是从raw data中看的，虽然准确但花了一些...
摘录：生信技能树论坛 Kai statquest 要求：实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表...
Perl 命令行参数 -p和-n 【上集回顾】：上一次提到了-e参数，一般在使用perl的单行程序时都会加上-e参数。-e参数就是将后面引号内的内容当作perl代码执行。 这...
一般在转录组或者基因表达相关的文献中，末尾都会附上Accession Numbers，可以用这个编号在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库上下载该研...
具体实例在5 一步法找基因变异流程samtoolsmarkdup操作的正确顺序 The first sort can be omitted if the file is al...
权限简介 Linux系统上对文件的权限有着严格的控制，用于如果相对某个文件执行某种操作，必须具有对应的权限方可执行成功。 Linux下文件的权限类型一般包括读，写，执行。对应...
我们可以使用正则表达式实现文本替换，即使用新的文本替换到正则表达式模式所找到的文本。利用 Regex 对象的 sub() 方法来实现，它需要传入两个参数，参数类型都为字符串。...
刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文，当时简单做了了解，但有朋友说意犹未尽，嗯我也这么觉得，总觉得还是学的不够。推荐阅读：https://github...
1. 加载基因组文件 Genomes➡️Load Genome from File➡️点击自己的基因组 2.加载gtf/gff文件 2.1. Tools➡️Run igvto...
2.软件以及流程以及代码： 本实验使用常规的Tophat2 比对 （1）样本制备、建库：总RNA ---> polyA富集mRNA ---> 打断 ---> 随机引物反转录成...
