是的，本篇不讲解软件的安装使用，因为网上的教程已经非常多了。 但是有关rMATS的输出结果，网上的教程都很少提到，结果应该怎么看？各文件各列代表了什么信息？很多老师或同学们拿...
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是的，本篇不讲解软件的安装使用，因为网上的教程已经非常多了。 但是有关rMATS的输出结果，网上的教程都很少提到，结果应该怎么看？各文件各列代表了什么信息？很多老师或同学们拿...
RNAseq的第二步就是Aligment, 一般都是有参考基因组的比对，据同事介绍，比对这一步，比对率再80%以上才算是正常的，很多样本的比对结果都能达到90%以上。 然而，...
写在前面 前段时间，推过两个教程，分别是：1.《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...》2.《「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握》 ...
跑了blastp发现输出格式没有标题： 查找了一下，列名分别为： qseqid query (e.g., unknown gene) sequence id sseqid s...
第一次做差异剪接分析，rMATS做完后一头雾水，查阅资料整理了一下结果文件。 我使用的版本是v4.1.2，用conda安装的，软件的安装和使用就不细说了，网上已经有很多帖子，...
TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
在硕士就读期间，就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少， windows 系统分析就足够了，作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。后来，随着高通量测序成本的降低...
1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集，它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
生物信息的传递- 从DNA到RNA 转录是基因表达的核心步骤 因为只有mRNA所携带的遗传信息才能被用来指导蛋白质的生物合成，所以人们一般用U,C,A,G这四种核苷酸的组合来...
当使用snpEff创建数据库的时候使用以下命令 突然报错 如果发现此错误，则意味着gtf文件中有一些基因，而fasta文件中没有因此，我们只需要在gtf文件中删除该基因即可 ...
snpEff的使用是在Linux系统中Java运行环境下。 一、下载snpEff 方法一： 直接在家目录下载使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
EMBOSS 序列提取程序 extractseq 双序列比对 needle water stretcher: 改进的Needleman-Wunsch动态规划算法局相似性双序列...
一、 安装 使用conda安装Pfam_scan pfam_scan依赖bioperl，因此，通过conda安装简单快捷. 安装hmmer3 , 使用以下命令安装： 数据库下...
