这个只针对人类的吗?有其它
物种的不?
GWAS分析-说人话(15)- 如何查看SNP所在的基因前言 当我们获得一堆“感兴趣”/“有意义”的SNPs之后, 怎样知道这些SNPs所在的基因呢? 不要告诉我一个一个在pubmed查就好~ 我们需要知道Plink哪个参数可以帮...
你好,请问下如何计算每个PCA的占比率呢?
「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA图主成分分析(PCA)是一种线性降维方法,能从纷繁复杂的数据中抽离出关键因素,用来区分不同的样本。这里我们不谈PCA背后的数学原理,只谈哪些软件能够处理数据,我找到了以下三款 ...
在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是非常常见的内容,同时也是关联分析的基础。在很多的遗传进化GWAS的文章中都会出现LD衰减或者block单倍型块的图。那么什么是连锁不平...
请问下染色体编号是一定是包含rs这样的格式吗
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算...