搜寻数据集及下载数据 差异分析--->差异表达基因 --->五大数据库注释--->蛋白互作等网络和通路注释 今天先为大家分享第一步“数据下载”,...
GFF和GTF是两种最常用的数据库注释格式,在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件,提取需要的信息进行注释。Cuffli...
参考://www.greatytc.com/p/1bc986ee1a9e[//www.greatytc.com/p/1bc9...
转载自:https://mp.weixin.qq.com/s/VxAOXz-jueAgbYdbdASAUw http://www.bioon.c...
串联法和并联法构建进化树 串联法(Concatenation):先将不同物种之间的每个单拷贝基因单独进行多序列比对,然后将这些比对后的单拷贝基因...
下载目标物种的蛋白质组序列 使用哪个蛋白质组版本 OrthoFinder 使用蛋白质编码基因的氨基酸序列。这通常位于物种的文件夹中,称为“注释”...
安装orthofinder 使用conda安装 安装软件前,先设置一个小环境,不要直接在自己账户的当前环境内安装软件;你可以创建很多小环境名,...
下载最新版本的linux版示例:wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/mi...
退出 conda base 虚拟环境回到系统环境 conda activate and conda deactivate only work o...