写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...
无论是Windows,MacOS, Linux桌面的用户,你都可以也会使用。 写在前面 伴随基因组测序的普及,越来越多物种的基因组测序项目开展并报道,为科研工作者提供了更为全...
首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具,为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白,在做多物种间共线性分析时,尝试了多种方法,苦于没有计算机基础,一直没能完成...
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
本次笔记分享主要参照 Y大宽和生信札记 的推文以及自己实际用过过程中的一些心得编写! 一、大致思路 也可以参见:基因家族分析[//www.greatytc.com/...
这个优秀 !
写在前面:在基因家族生信分析(二)这篇文章里,简单提到了一种基因结构绘制的方法,当时是跟着视频课做笔记,没有实际操作。直到今天实际操作了一下,发现有很多需要注意的地方,今天就...
启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被...
Hi,大家好。对于做实验的小伙伴来说,我们经常需要构建进化树,那么很多人应该都会选择MEGA(Molecular Evolutionary Genetic Analysis)...
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后...
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
一、InterPro数据库简介 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库。 Interpro数据库成员包括Coils 、Gene3D、...
ensemble数据库的功能非常多,在此主要介绍用ensemble下载目标物种的全基因组文件和基因注释文件,以及如何用ensemble进行blast
转录组测序的最直接目的,就是设法寻找组间显著表达变化的基因,解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如,肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调,这些...