你好,我想问一下,如果是四条染色体进行比对的话怎么办,只需要按照步骤2-5,进行Ch1和Chr4的共线性分析就行了吗?
用TBtools,快速高效实现基因组共线性分析与可视化, 赞!写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
你好,我想问一下,如果是四条染色体进行比对的话怎么办,只需要按照步骤2-5,进行Ch1和Chr4的共线性分析就行了吗?
用TBtools,快速高效实现基因组共线性分析与可视化, 赞!写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
写在前面 一年前,我看到课题组其他成员在整一个“进化保守区块”挖掘的工作。说实话,觉得....挺麻烦。于是我写了一个工具,具体见推文《进化保守的基因区块-可视化挖掘》。 这个...
我有无数次想放弃继续开发 TBtools 的想法,原因种种。有时候会想得很清楚,这本来就是一个不务正业的副产品;有时候会觉得很痛苦,尤其是一些人就是不愿意在社群讨论,一定要找...
看我们这样的菜鸟把大佬都逼成啥样了,惭愧惭愧啊
直到现在,我仍常常有放弃 TBtools 的想法我有无数次想放弃继续开发 TBtools 的想法,原因种种。有时候会想得很清楚,这本来就是一个不务正业的副产品;有时候会觉得很痛苦,尤其是一些人就是不愿意在社群讨论,一定要找...
写在前面 知道我的朋友,相信都有了解,元旦假期某晚凌晨,我突发起来,折腾了一个困扰我很久很久的问题,并解决了他。2015年,TBtools 开发之前,我写过一个 Blast3...
按这个步骤做出来的图是空的啊?
如何高效而且优雅地比较多物种的不同基因组区域?写在前面 高通量测序技术的普及,带来的是遍地的基因组。昨日,OneKP项目又发了一个Paper【因为很久以前他们就发过,数据也早就可以获取】。他们再发多少paper,事实上,...
做科研的都知道开创性的工作自然意义重大,但那是可遇不可求。迅速跟进大牛们开创性的思路或者方法,结合自身的研究基础,做出类似的成果无疑是个高效的策略。 早些年的转录组可谓是典型...
最近,小编看到这样一种说法“基因家族分析类文章已经过时了,很难再发SCI了”。这是真的么?答案当然是否定的!闲暇之余,小编搜索统计了2020年截至到今天的基因家族分析文章的数...
一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...
根据已有的蛋白库,对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对,从而获得相应的信息。 常用的数据库: Nr:NCBI官方非冗余蛋白数据库,包括PDB, Swiss-Prot, PIR...