1.问题起源 predict的参数type默认值就是“lp”,代表线性模型,理论上和大量文章里描述的公式应该是结果相同的。比如这个: https://www.ncbi.nlm...
1.问题起源 predict的参数type默认值就是“lp”,代表线性模型,理论上和大量文章里描述的公式应该是结果相同的。比如这个: https://www.ncbi.nlm...
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
太优秀啦
细胞类型鉴定--单细胞marker基因(持续修正)细胞类型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
前段时间在生信技能树单细胞学习小分队分享单细胞文章复现,一不小心就踩了一个坑……记录在这儿和大家一起分享。 背景 主要是想复现2020年发表在 PNAS 上的一篇题为 Sin...
老师,看了您的文章受益匪浅,再回头学习您这边文章的时候,想请教一下在一开始对merge后的Seurat对象进行标准化和降维时为啥不直接用Sctransform函数操作,而是一步一步标准化、归一化、找差异基因呢?😊
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
谢谢老六👍
Seurat对象数据结构1、标准流程里面的过滤三步骤,也可以用 SCTransform 代替 Seurat基本教程[Seurat%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E6%95%99%E7%A8%8...
请问这个文件找到了吗?
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...