![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/4-3397163ecdb3855a0a4139c34a695885.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
为什么需要标准化 标准化的主要目的是去除测序数据的技术偏差:测序深度和基因长度。 #测序深度:一个片段测了几遍 #测序覆盖度:测序片段匹配到目标区域的百分比 测序深度:测序深...
背景 feature 定义:基因组上对具有不同性质区域的定义 (例如:gene/exon/intron/miRNA等)。 优点:利于分类整理结果。 两类测序bias 长度bi...
使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
最近接手了宏基因项目,会在之后接着发一系列的宏基因组入门教程,学习资料大概来自国外的教程。感谢Harriet Alexander, Phil Brooks, C. Titus...
学术PPT分不同的种类,他们相互之间结构类似,但是具体细节和侧重点又各不相同。本文主要覆盖了开题,调研,工作汇报(毕业答辩),项目申请(部分)这四大类来进行阐述。 PPT一方...
刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识,总能从不同角度获取一些观点,然后扩增自己的知识库,这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪,把自己认为重要的内容梳理下,用Q...
一、Solexa测序技术前世今生(——Illumina平台) Solexa高通量测序技术是由英国剑桥大学派生的Solexa公司建立起来的。该方法以单分子阵列技术为基础,是对合...
宏基因组的数据文件很大,难以用个人电脑完成分析,用Seqtk软抽取少量序列进行分析,以达到管中窥豹的目的 安装 使用 抽取1000万条序列。 根据序列ID提取fasta序列