拟时序(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况通过拟时分析可以来推断发育过程细胞的分化轨迹...
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CibersortX网站是常用的工具,但是是网页上传数据,现在网页503打不开,而BayesPrism在PMID: 37717006[https://pubmed.ncbi....
影响因子:7.3 研究概述:作为最致命的乳腺癌亚型,三阴性乳腺癌(TNBC)是一种侵袭性极强的内分泌恶性肿瘤,复发率和远处转移率都很高。尽管化疗和新辅助免疫疗法在改善患者预后...
翻译自:http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-hazards-model[http://www.sthda.c...
在使用Seurat时,经常需要对不同分类的样本在同一画布上进行可视化,可以非常方便地通过其DimPlot()函数的goupyby和spliby等参数实现,例如对照组和实验组,...
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据,有时由于下游分析的需求或可视化的需求,同时由于python的运算速度的优势,目前越来越多单细胞分析的工具开始在python环境下开发(...
在加载包SeuratData是遇到了以下报错: 重装还是不解决问题,之前使用也没有出现过报错。 检测.libPaths()路径也是没有问题的,所以有可能为内码冲突问题 在操作...
1.报错 在安装Seurat会出现如下核心报错: 2.原因 尝试手动下载解压安装rgeos、从Github上安装Seurat、修改镜像,都不解决问题,因为着根本不是下载的错误...
在进行一些数据分析是经常会需要将一个数据对象转化为矩阵,以及稀疏矩阵(sparse matrix)和稠密矩阵之间的互化。 问题&报错 在R环境中,用的非常普遍的函数就是as....