现在都是流行追热点,例如m6A这个研究热点,很多人利用它发了n篇纯生信数据挖掘的文章;再比如铁死亡这个研究热点,有一大堆纯数据挖掘的文章正在投稿中;现在我们看看这个已经发了无...
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今天讲经济学怎么看待投资和消费之间的关系。 你觉得投资和消费两者之间,投资就是投资,消费就是消费,这不是很清楚么?我问你,今天中午吃盒饭,这是投资还是消费?吃饭当然是消费,但...
GSEA下载 进入下载页面,首先需要注册邮箱,然后按照电脑系统要求点击下载就Ok了。链接如下: https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downlo...
杂志概要 今天要介绍的期刊是cancer immunology research,创刊于2013年,同Clinical Cancer Research、Cancer Rese...
入门必读://www.greatytc.com/p/85e2e38df673 Q1:有的群2个或者3个不同细胞类型marker高表达,这时候如何给群定义具体哪种细胞...
做转录组一般拿到基因表达矩阵之后工作即可开始做差异分析,在此之前还有一步就是对矩阵做标准化,常见的几种RPKM、FPKM、TMM等,虽然RPKM、FPKM方法被吐槽的尤为厉害...
列线图简介 列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图),它是建立在多因素回归分析的基础上,将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,...
在前面的count normalization的方法部分,我初步介绍了一些常见的count normalization的方法,这部分我会写出对应的代码。用的数据集是我自己的一...
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第二期-三阴性乳腺癌(TNBC)这个数据集一共有三篇文章对他进行了数据挖掘: PMID: 25208879 PMID: 269213...
文库标准化的目的 RNA-seq每个基因的长度和深度均不相同,所以需要对基因的长度和测序深度进行Normalize 输入 一个Read Count的数据矩阵(行为基因,列为样...
表达矩阵标准化是差异分析的第一步,关于为什么需要标准化及常用的标准化的方法有哪些的一篇笔记。 参考文章 为什么需要标准化? 转录组测序采取的打断基因序列获得基因测序的片段,再...