进行这步分析python -m jcvi.graphics.karyotype seqids layout
报错IndexError: list index out of range,该怎么解决
共线性分析 | MCscan (Python version JCVI 包)共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。今天主要测试的是Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,是从MCScanx升级而来的基因组共线性分析软件。 ...
进行这步分析python -m jcvi.graphics.karyotype seqids layout
报错IndexError: list index out of range,该怎么解决
python版的MCScan绘图最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来。github地址 https://github.com/tanghaibao...
1.MCscanMCscan绘制共线图MCscan需要准备cds.fasta和.gff注释文件cds.fasta文件可以从基因组序列中提取 配置layout文件 y:调整染色...
1、报错信息:AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color' 解决方案:在color一列输入指定颜色...
最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来。github地址 https://github.com/tanghaibao...
请问合并后的1.geneLinks.tab.xls的格式是如何的,可以分享一下吗?
零基础多物种间共线性分析首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具,为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白,在做多物种间共线性分析时,尝试了多种方法,苦于没有计算机基础,一直没能完成...
冒昧请教
Error: Require Genotypes in VCF file in order to output Fst statistics.
请问这个报错该怎么解决
Fst的计算原理与实战概念回顾 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为...
vcftools --vcf test.vcf --weir-fst-pop 1_population.txt --weir-fst-pop 2_population.txt --out p_1_2—single
可以麻烦将pop 1_population.txt和pop 2_population.txt的数据展示一下吗
群体中的Fst值-学习篇这里有一份群体的学习课程,这篇推送主要基于这个作为参考,群体课程[http://www.uwyo.edu/dbmcd/popecol/index.html]Fst值[http...