1.背景知识 在一篇文章里看到了微卫星不稳定性(Microsatellite Instability,MSI)与riskscore的关系图,就去查了一下,很好的背景知识资料:...
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有的人说纯生信很难发表,有的人说纯生信不难发表,基本一个月就可以发表一篇,感觉发SCI太容易了。说纯生信难发表的人基本都是做一些比较旧的分析套路,这样的文章已经出来了一大堆,...
年底复盘,发现很多知识点理解并不深入,想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响,我们需要对单细胞counts矩...
官方网址:The Composer of Plots • patchwork (data-imaginist.com)[https://patchwork.data-imag...
细胞配受体通识以及常见细胞分泌信号通路[//www.greatytc.com/p/df4721d29a91]CellChat:细胞间相互作用分析利器[https:/...
参考文献:stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads帮助文...
在看文献Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 rev...
typora-让你爱上Markdown,从此无法自拔下载地址 for Windows[https://www.typora.io/#windows]其他系统可进typora官...
PS:一直以来对SVD分解似懂非懂,此文为译文,原文以细致的分析+大量的可视化图形演示了SVD的几何意义。能在有限的篇幅把这个问题讲解的如此清晰,实属不易。原文举了一个简单的...
富集分析是一种大家常用分析方法;msigdb数据库中有定义好的基因集,但其中绝大多数数据都是人类的;老鼠和其它物种的基因集有的,但是比较少,无法满足大众的需求。msigdbr...
clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
cross_entropy-----交叉熵是深度学习中常用的一个概念,一般用来求目标与预测值之间的差距。 在介绍softmax_cross_entropy,binary_cr...
#igraph 包介绍 igraph是一个用于网络分析的库和R包。 ##igraph的作用 igraph库的主要目标是提供一组数据类型和功能,以实现以下目的:1)轻松实现图形...
中心化、标准化、归一化 图.左边是原始数据的分布情况、中间是经过中心化的分布情况、右边是经过标准化后的情况。图片来自知乎 说明:本文纯属胡说,没有加入严谨的数学推导,如有问题...