EndHic 想比较HiC-Pro,EndHic的安装就简单很多,就是下载即可用 EndHiC的安装 要用到的脚本都在文件夹下,直接调用就行 怎么使用呢?不得不说一下,git...
并没有看到与疾病如何关联的分析过程
hdWGCNA系列推文(二):分析单细胞转录组数据前言 Immugent在hdWGCNA系列推文第一篇:hdWGCNA:将单细胞和空间转录组的WGCNA分析变成现实[https://mp.weixin.qq.com/s?__...
进到align目录对质量好的测序数据进行比对 1. 一个个比对,生成BAM文件 align目录 不用-R参数也可以执行,但后面gatk的时候会报错 2或者循环批量比对 增加第...
这个介于3和4之间,目的是练习几个有用的脚本,学几个命令。 随便找几个文件进行练习,只是为了说明问题,这些其实是RNA-seq数据,但无所谓,只是看脚本的处理有以下几个文件 ...
原视频6:测序质量的控制首先建立文件夹 这部分包括fastqc和multiqc两个软件查看测序质量,以及使用trim_galore软件进行过滤低质量reads和去除接头。 1...
WGCNA原理和分析流程[//www.greatytc.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[https://www.jian...
目的:把两组bed files 分别pool成一个bed file,而且叠加到序列区间要merge起来。合并:cat *.bed > output.bed软件:需要 bedt...
从今天开始,我又要经常回到简书记录一些数据下载,处理流程了。目前需要UKBB的GWAS, 用的人很多,都是大文章,大手笔。我没有找到怎么下载的。所以打算自己跟着帮助文档学习一...
QQ-plot图 发现个超级好的贴,忍不住粘过来啊,好东西要传播啊,不是打广告啊。 附链接:http://www.genedenovo.com/news/391.html Q...
想着好久没更新了,但我的粉丝们还是会经常来看看我,所以,决定把最近学的东西挂出来。 搜了下中文网,几乎没有对这个方法进行介绍的,一个可能是新出的,一个可能是手里没有大样本,不...
Note that if Boost is installed in a non-default location then its path should be specified with BOOST_ROOT in the cmake command above:
$ cmake -DBOOST_ROOT=/path/to/boost/ ..
If all of the above steps were successful, the build directory now contains ExpansionHunter executable.
1.环境变量 boost cmake 2.安装ExpansionHunter 3.ExpansionHunter的用法