首先准备好整理完毕的蛋白序列，打开MEGA-Align-Edit/Build Alignment OK-Peotin-粘贴蛋白序列 对齐-直接选默认参数 保存 导入刚刚保存的...
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首先准备好整理完毕的蛋白序列，打开MEGA-Align-Edit/Build Alignment OK-Peotin-粘贴蛋白序列 对齐-直接选默认参数 保存 导入刚刚保存的...
使用GATK进行SNP和INDEL检测GATK是 Broad 开发的用于测序数据的变异检测软件，后续推广到动植物研究中，是目前最广泛使用的变异检测软件。GATK有两种方式变异...
下游分析 下游分析可能是比较成熟化的流程分析，对服务器的要求比较高一些，下游分析则是对背景知识要求高一些，例如VCF的格式，遗传学的三大定律等。 让我们先安装并加载所需的R包...
QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包，它能够读取GATK输出结果进行过滤，最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。我们这次尝试使用这个R包来替代我们自己...
BSA虽然不是我最早接触的高通量数据分析项目（最早的是RNA-seq），但是却是我最早独立开展的数据分析项目， 我曾经专门写过一篇文章介绍如何使用SHOREMap做拟南芥的E...
分离体分组混合分析法（Bulked Sergeant Analysis, BSA）也称为集群分离分析法或混合分组分析法，是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
