境或人体微生物中广泛存在着菌株水平的差异,这些菌株个体水平的基因差异决定了其功能执行上的显著不同。宏基因组测序是对人体或自然环境样品进行菌株水平研究的唯一途径[1]。而环境样...
境或人体微生物中广泛存在着菌株水平的差异,这些菌株个体水平的基因差异决定了其功能执行上的显著不同。宏基因组测序是对人体或自然环境样品进行菌株水平研究的唯一途径[1]。而环境样...
以下是我简书里所有的文章链接,按不同的专题分类,方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...
1. 数据下载 SRP077971 选取其中三个wes下载 下载sra数据,每个耗时~25min sra转为fastq.gz(每个耗时~30min) 3. 质控 3.1 序列...
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参考基因组及必备的数据库 参考基因组下载 我是从服务器上下载下来放本地电脑了 下载方式1: 直接去gatk官网下载,下载链接为ftp://ftp.broadinstitute...
00 写在前面 仅针对人类WGS或WES数据,供参考。时间管理某一点:能自动化的工作尽量自动化,不要时间用在毫无意义的重复上。脑袋好比肌肉,需要不断提高负重的锻炼才能达到“有...
首先创建一个项目目录wes和存放每个步骤生成文件的子目录raw, clean, align, genome, hg19_VCF 此流程包含两个raw外显子测序文件:wes.1...