0.介绍 本文的数据出自2017年的一篇文章：Seven-CpG-based prognostic signature coupled with gene expressio...
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0.介绍 本文的数据出自2017年的一篇文章：Seven-CpG-based prognostic signature coupled with gene expressio...
Overview 由于在单细胞数据（如RNA-seq、ATAC-seq）中观察到的稀疏性，细胞特征（如基因、峰）的可视化经常受到影响和不清楚，特别是当它与聚类重叠以注释细胞类...
简介 plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能，可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图，主要依赖于Seurat V4，circlize，Compl...
在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
今天再学习一下第三个适用于单细胞转录组数据的细胞通讯工具:NicheNet，与其他常见细胞通讯分析软件（CellphoneDB，cellchat等工具）相比而言，NicheN...
先记录一下，我安装过程的惨痛经历😭，希望小伙伴们避免像我一样入坑。起初每一次安装，不论是使用conda还是pip工具，发现安装好的CellphoneDB（4.0.0）在she...
现在开始学习第二个适用于单细胞转录组数据的细胞通讯工具:Cellchat,也是比较常用的。相较于CellphoneDB的数据库(配体-受体+多聚体),CellChat在模拟细...
写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化，因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例，介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。 一.下载 下载链...
