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一、OTU聚类 1.1 为何要进行OTU聚类 a) 测序完成后，每例样品的测序序列达到几万条，对每一条序列当然都可以进行物种注释，但这种方式工作量大，毕竟每一条序列均需要与数...
阅读文献的过程中，总会碰到microbiota, metagenome, microbiome这三个关键字，不太清楚它们的具体意思什么，以及它们之间的区别，估计很多朋友也有此...
微生物群落测序是指对微生物群体进行高通量测序，通过分析测序序列的构成分析特定环境中微生物群体的构成情况或基因的组成以及功能。借助不同环境下微生物群落的构成差异分析我们可以分析...
笔记内容：由二代测序产生的序列数据（fastq格式）到物种丰度的OTU table， 样本群落距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的分析结果，为常规分析流程。...
笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程。可以使用usear...
1. Abstract 1.1 Background 在玉米中，低氮，低盐，干旱胁迫下的miRNA及其靶基因研究较多，但在玉米穗子中相关研究较少。这篇研究的目的就是为了鉴定四...
