年中总结接近尾声,我们学习一些基础的画图知识 GraphPad prism绘制出来的图形有其独特的风格,并且绘制的图形也很漂亮,但是正版软件的售价很高,使用破解软件绘制的图形...
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之前我们已经和大家分享过如何上传GEO数据[//www.greatytc.com/p/40d474378bbb],同样,我们也可以从公共数据库下载其他研究者的数据进...
前两次教程“GEO数据挖掘(一)简单快速下载GEO数据[//www.greatytc.com/p/88b5db10f00d]”、“GEO数据挖掘(一)下载SRA库原...
数据来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
数据来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
一、举例回顾 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,前3个为正常肾小...
一、举例介绍 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,另3个为正常肾小球...
1-1从GEO数据库下载数据 1-2提取表达矩阵exp 1-3提取各样本的分组信息 1-4调整exp的行名顺序与pd列名完全一致 1-5提取芯片平台编号,保存 2-1提取分组...
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言?[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习R语言[https://www...
前两天我们对GEO数据库来了一个大致的介绍。我们对于目标数据集,我们做的第一个事情就是差异分析,来寻找有差异的结果。所有的表达芯片做的差异表达分析都是基于limma的算法来的...
生信学习资料 自学生信不求人,现在网上资料越来越丰富,但是资料多也意味着鱼龙混杂,并且让人无从选择。正确做法应该是,找一个适合自己且完善靠谱的学习资料,从头到尾跟一遍,代码敲...
在求学阶段,经常听到老师或者没有做生信的同学说生信就是跑流程的,一些大佬也有发文自嘲和解释过生信不是跑流程。我自己在刚上手生信分析时,对这个说法强烈反对,参加工作或者说上手多...
写在前面 目前各种组学培训开展的如火如荼,却鲜有生物信息学数据库搭建的相关教程和学习流程。原因有以下几个: 1.学习数据库的搭建付出多,回报少。有这功夫应该可以把大部分组学知...
随着一批国家的生物银行的完成和结果公布,多个Biobank的GWAS summary statistics文件已经公开,这里列下不同国家的相关资源,这些资源基本是使用开源的p...