这里是佳奥! 我们进入到作者的GitHub下载一下代码来看看吧。 1 作者原始代码 当然,由于package的版本日新月异,除非安装相同版本的package,我就不运行了,作...
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最近我们连续解读了3篇P53在CRISPR-Cas9基因编辑过程中的影响,目前第4篇还在撰写中。为了调剂一下文献阅读的凝重感,今天咱们更点短小精悍的。在我们之前的推文中提到过...
GUS应用及原理 Gus基因存在于某些细菌体内,编码β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS),该酶是一种水解酶,能催化许多β-葡萄糖苷酯类物质的水解。因为绝...
VCF格式 VCF(Variant Call Format)格式,是用于记录基因序列变异信息(gene sequence variations)。也是做基因组群体相关分析首先...
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的学习 1.什么是vcf?VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文本文件。在GATK软件中得到最好...
目录 前言[//www.greatytc.com/p/729673778e43] 方法简介[//www.greatytc.com/p/d9bd081763...
写在前面:当学习某一重要文件格式时,更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习(如sam/bam——samtools)。在多次花时间写脚本处理文件之后发现,80%左右的任务其实...
经过了第四节的长文,我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文件我没能展开来讲,分别是:BAM和VCF文件。这篇我们先说B...
写在前面 全基因组层面可视化特征标记(如基因位点),从文字标签到图形标签。文字标签应该是三四年前实现的。图形标签,Emmm,事实上,这个功能已经实现了太久,以至于我自己只记得...