论文 Independent phenotypic plasticity axes define distinct obesity sub-types https://www...
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七、支持向量机 7.1 概述 功能: 用的最多的是分类,不过做其他的也有不错的效果 对于三种不同的输入数据,每种分类器的表现。可以看出SVM最棒 SVM是最接近深度学习的机器...
最近越来越多的分析需要用到loom文件,其中主要是python的数据分析以及RNA速率分析的时候,格式之间的转化需要我们分析一下,这里分享给大家R及python对于loom文...
在单细胞测序的轨迹推断[//www.greatytc.com/p/83c532234dc0]中,我们介绍了RNA速率分析的原理,进行速率分析的前提就是需要得到未剪切...
RNA注释 这里以inDrop 实验数据举例,spliced/unspliced的RNA可以通过: 1.使用dropEst 输出管道生成 类似10X的 bam 文件: 2.使...
微分动力学 一个重要的问题是处理代表多个谱系和过程的系统,其中基因可能在亚群中表现出不同的动力学行为。不同的细胞状态和谱系通常受基因调控网络中不同变异的制约,因此可能表现出不...
前言 关注生信宝库时间比较久的小伙伴会发现,我们除了更新免疫相关的推文外,最多的就是单细胞研究相关的算法的文献解读了。最近有一位粉丝通过后台和我们说能不能更新一些单细胞联合b...
作者,追风少年i 周五了,一周马上过去了,感觉如何??? 和很多人交流,发现一个很有意思的现象,每个人都盯着自己没有的东西,自己拥有的都选择忽视,这样的态度,是不是我们烦恼的...
Bio.tools bio.tools · Bioinformatics Tools and Services Discovery Portal[https://bio.to...
论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
非肿瘤生信不好发?非肿瘤生信机器学习与实验验证不会结合?这些都不是问题,现在我们手把手分享一下非肿瘤生信机器学习+实验验证的思路,具体分析步骤如下: 分析流程 第一步,差异分...
论文 Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding https://w...
我转换之后出现了缺失值
FPKM转TPM我们做转录组分析,得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性,推荐使用TPM。 read count和FPKM结果都可以转成TPM,但是因为FPKM跟TPM的计算...
前面给大家介绍了 ☞[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz%3DMzI4ODE...
单细胞测序数据经Seurat包tsne降维聚类后,得到cluster,如何找出cluster的marker并进行GO、KEGG分析 需要R包:Seurat、clusterPr...
超级好超级好,今天所有的问题都解决了,博主yyds!冲鸭🦆
Scissor:联合表型数据,Bulk-seq和scRNA的分析软件前言 作者开发Scissor的目的是结合bulk-seq的数据,寻找与某一性状显著相关的单细胞亚群,然后从表型的角度解释这些细胞亚群的生物学意义。作者开发Scissor的动机...