基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因,是遗传变异一个非常重要的来源,...
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因,是遗传变异一个非常重要的来源,...
从获取下机数据做质控、比对,到calling snp获得vcf文件这一步,网上已经有非常详细的教程,有GATK4.0和全基因组数据分析实践(上),还有Samtools+bcf...
主成分方差解释率计算 通常,求得了PCA降维后的特征值,我们就可以绘图,但各个维度的方差解释率没有得到,就无法获得PC坐标的百分比。 有些工具的结果是提供了维度标准差的,如g...
基因结构注释的方法包括: 从头预测根据基因结构的特征,基于算法(大多为隐马尔可夫模型)进行预测 蛋白注释根据物种自身(或近源物种)的蛋白序列,进行注释 EST 注释根据物种自...
由中国农大王雅春教授给出的报告-深入挖掘基因组选择计算的应用前景(2022/3/30) 报告的提纲: 动物育种学的概念 奶牛育种的特点 提高群体的平均值,变异降低 奶牛育种体...
大家好,今天给大家分享的是一篇发表在BMC Plant biology上的关于 利用crispr-cas9技术实现植物快速育种的文章。 文章题目:Plant breeding...
最近在处理PacBio的HiFi数据,记录一下分析的过程。 背景介绍 今天介绍的这个软件叫做HiFiAdapterFilt,是一个用于从PacBio的原始数据中去除掉HiFi...
最近看了不少统计基因组方面的资料,以为懂了,其实懵逼。实在是因为统计学基础太菜,似懂非懂,似是而非。记录下自己的理解,求轻喷。 1.GWAS模型 GWAS是表型和基因型之间的...
混合线性模型是把因变量分解成固定效应值和随机效应值的组合。其一般形式为: y 是因变量,β是固定效应,u 是随机效应,X 和Z 为对应的设计矩阵,ε是残差。由于β是固定值,所...
来源:https://www.g3journal.org/content/10/2/581.abstract阅读人:刘绵宇 摘要 基因组选择使关键生产性状(如抗病性)的遗传进...
鹦鹉螺基因组以“The genome of Nautilus pompilius illuminates eye evolution and biomineralizatio...
随着基因组测序爆炸性增长,比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢?比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之...
高质量红花蜡梅基因组为木兰类进化及其花色形成机制研究提供了新见解 蜡梅(Chimonanthus praecox)隶属于木兰类蜡梅科蜡梅属,因其独特的花香和众多的次生代谢产物...