这里是佳奥<br><br>有疑问欢迎email或yuque平台<br><br>专注多组学挖掘基因，以及非模式植物的下游注释以及可视化工作
IP属地：山东
这里是佳奥，我们继续RNA-Seq分析的结果探究。 第三步，DEG-差异分析。 1 RNA-Seq结果分析：DEG 归一化后表达量成一条线了。 2 ChIP-Seq结果分析：...
这里是佳奥！ 获得了比对的bam文件，生成了index的bai文件，生成了比对结果stat文件。 合并bam文件和去除PCR重复没有严格先后顺序，是否必要根据文章决定 1 合...
三代测序数据简单分析 原创 saber universebiologygirl 简单介绍： 三代测序技术读长较长，针对比较小的基因组像只有16kbp的人类线粒体DNA（mtD...
写在前面 最近，带一个师妹了解并做了简单的基因组组装工作，感觉其上手速度还可以。慢慢地有初窥生物信息学数据分析门径的样式，于是....还是鼓励她整理整理流程，分享分享（其实....
wtdbg2软件介绍 wdbg2能利用三代Pacbio 或 Nanopore 测序数据进行基因组组装。在组装过程中，软件将reads打断成长度为1024 bp的片段（类似km...
我也认为长读长测序是 RNA 测序的未来！随着价格的降低和碱基质量的提升，传统的二代RNA-seq会被逐渐取代。 很多物种的转录本非常多样和复杂，绝大多数真核生物基因不符合“...
ChromHMM教程ChIPseq教程从这个网站下载数据，放在Bed_input文件夹里面。同时按照上述教程制作与下载的bed文件同样名字的cellmarkfile.txt文...
Nanopore native RNA sequencing of a human poly(A) transcriptomeFLAIR原始文章 FLAIR分析流程 Nano...
1.背景知识 1.1什么是可变剪切 可变剪切（differential splicing）也叫做选择性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前体到成...
什么是ChIP-seq？ ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）与二代测序技术的结合，通过染色质免疫共...
目前，六分之一的夫妇患有不孕不育，其中多达一半的病例由男性因素引起，在过去的40年中，精子数量下降了50%。尽管导致精子质量和数量下降的因素知之甚少，但环境-表观基因组相互作...
在分析单细胞转录组测序数据前，我们需要将原始的fastq测序文件转化成我们可读的数据，最好的方法是将数据整理为基因-细胞表达矩阵，如此一来后续的分析就能够直接读取到某细胞的某...
2018-9-21 梗概 安装单细胞测序数据处理软件Cellranger 安装R包Seurat 下载cellranger参考数据Human reference (GRCh38...
ChIP-seq试验普遍用于探究蛋白质与核酸的结合作用。例如最常见的，期望获得某个转录因子的功能，查看它结合到哪些基因启动子区域并调控它们的转录，以及更高级的分析识别该转录因...
全文分析流程学习按照：九月学徒ChIP-seq学习成果展 一、 怎么将SAR文件转为fastq文件？ 1. 【方法】利用软件sratoolkit，下载后解压，找到其中的 f...
