首先介绍一下megan中的blast2lca工具,这里主要作用是使用NCBI-blast或diamond与NCBI-nr库进行比对后,将比对结果通过lca算法运行,得到最大可...
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CARD官网:https://card.mcmaster.ca/[https://card.mcmaster.ca/]数据下载:https://card.mcmaster.c...
文献信息:标题:PathoFact: a pipeline for the prediction of virulence factors and antimicrobial...
https://blog.csdn.net/weixin_40013463/article/details/81735304[https://blog.csdn.net/we...
生物与计算机的结合让生物进入大数据时代,为方便管理各种生物数据,科学家们开发了各式各样的生物数据库。了解与自己研究领域相关的数据库,并加以利用可能会使研究工作得到事半功倍的效...
Contigs/Scaffolds序列经基因预测、ORF开放阅读框识别(Open Reading fr ame)和蛋白翻译之后,就可以进行功能注释分析了。我们将基因/蛋白序列...
文献代表 标题:Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized human microbio...
写在前面 生物信息操作中必不可少的就是各种软件的安装,不同于我们习以为常的Windows操作系统下软件的安装,Linux下软件的安装通常涉及源码的编译和二进制文件的下载,不同...
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=2247484028&idx=1&sn=3073a0a1d4428...
一:模型预测 1. swissmodel预测(网址https://swissmodel.expasy.org/) 原理:相似的氨基酸序列对应着相似的蛋白质结构要求:找到与目标...
大家好,本周给大家分享的是12月21日发表在Nature Communications上与欧洲酿酒葡萄的起源相关的一篇文章。 文章题目:The genomes of 204 ...