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1. 火山图？ 之前瞥到了小明的 跟着Cell学作图：R语言ggplot2作图展示差异表达的基因[//www.greatytc.com/p/ed1882db13d8...
从研一来到组里，一直听到 GO 富集分析几个字。直到现在，研二基本结束了，我都没做过，也不会做。有一个大概的认识，就是，自己的基因集中某种功能基因的占比要高于这种功能的基因在...
网上已经有很多教程，自己尝试梳理。 共线性分析，你会想到什么？基于蛋白编码基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
准备文件：test.cds.fa、test.pep.fa 1. 分步计算 1.1 序列全局比对 注意：这里我将同源基因两两配对，在实际分析中选择的是共线性块的基因对。 1.2...
https://stratigraphy.org/chart[https://stratigraphy.org/chart]，该表一直更新，还具有多种语言版本（英文版、中文版...
即使原gff文件中没有exon的信息，可以用 脚本 | Shell | 提取每个转录本exon坐标[//www.greatytc.com/p/92ef215932b...
很棒的分享加一
脚本 | R | 转录组 counts 2 tpm看了一些文章，方法很多。比如先定义函数，再用sapply......。我是个只会用tidyverse的R低端用户，而且定义函数过程中用到了log等一些数学计算，我不是很懂，只...
看了一些文章，方法很多。比如先定义函数，再用sapply......。我是个只会用tidyverse的R低端用户，而且定义函数过程中用到了log等一些数学计算，我不是很懂，只...
通常求表达量的相关系数，是每两个样本间或每两个基因间的，最后得到相关性矩阵。但是我想求一个基因在不同处理下的相关系数，或者特定的一对基因之间相关系数，怎么办？ 方法1. t...
不错，我用上了
脚本 | Shell | awk直接根据列名处理数据框1. awk直接根据列名处理数据框 R中tidyverse处理数据框非常方便，可以根据列名操作相应的列。awk 总是根据$n来操作第n列，当列数太多怎么办？怎么直接根据列名操...
1. awk直接根据列名处理数据框 R中tidyverse处理数据框非常方便，可以根据列名操作相应的列。awk 总是根据$n来操作第n列，当列数太多怎么办？怎么直接根据列名操...
网址：https://julialang.org/[https://julialang.org/] 下载安装添加环境变量 julia 进入交互界面， ctrl + d 退出 ...
之前一直不知道该如何学R，一直用awk等命令进行数据处理。 最开始看的《R语言实战》，了解了工作目录，数据类型，数据结构等； 后来看《R数据科学》（网上可搜中文版pdf，英文...
持续更新...... 针对OrthoFinder[https://github.com/davidemms/OrthoFinder]的结果Results_*/Orthogro...
会一点awk很容易上手 1. 介绍 https://github.com/lh3/bioawk[https://github.com/lh3/bioawk] 2. 安装 3....
不错，很有用的内容
三剑客 | awk我刚开始一直不理解 awk 的语法，后来看师兄的代码，加上天天敲，有了点提高。 师兄在 2020-07-03 常用有趣命令之数据处理[https://www.jianshu....
使用 grep、sed、awk 等命令，要注意正则表达式的灵活使用 Global Search Regular Expression and Print out the li...
几个月前的服务器大转移事件 具体情况服务器搬进机房后，配置了固定ip。远程连接，十几秒后断开。继续尝试，偶尔可以再连接上十几秒。 解决途径 连接超时网上大多数都是【连接超时】...
