简介 Drug2Cell 是用于scanpy中基因组活性评估的效用函数的集合,既用于每个细胞评分,也用于基于标记的富集/过表示分析。Drug2c...
《动物学科学研讨》课程老师让介绍一种测序技术,及其在动物学上的应用的,PPT共享! (每帖分享:时间应该被用在有价值且让你快乐的地方,而不是无意...
在使用FeaturePlot画图的时候会因为细胞太多存在一些细胞被覆盖的现象,导致表达某基因的细胞由于处于底层而展示不出来。我们如果想要让表达特...
1.软件和参考基因组文件下载 cellranger下载 建议下载比较新的的,我这个是因为想和原文保持一致所以才下载的老版本官网下载:https:...
在处理病毒数据的时候遇到一个问题,由于有不同病毒对应的 蛋白编码基因相同,导致读取的时候出现问题:主要是在R中"ORF1ab"读取为0但是sca...
为了使用DiffusionMap,需要安装destiny,但是遇到报错libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.3...
多次遇到rstudio-server服务器自己的用户登录不上,一直卡着,但是别人的用户能正常使用的情况,一般都是自己用户下出现了问题,下面总结几...
在多篇高分文章中都出现了评估细胞亚群纯度的内容,用到的是张泽民团队的ROGEU包。提出了一个基于熵的统计量(ROGUE)来准确地定量鉴定的细胞团...
h5Seurat 文件格式专门用于存储和分析多模态单细胞和空间分辨表达实验数据,例如来自 CITE-seq 或 10X Visium 技术的数据...