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    R进阶使用技巧

    Introduction 分享一些R进阶使用的技巧,相当于是之前写的R语言学习[../r-learning]的实践和总结了。 Online sl...

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    R调用Taxonkit展示系统发育信息

    Introduction TaxonKit[https://bioinf.shenwei.me/taxonkit/chinese/]是一个用于处...

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    宏基因组分箱(binning)|2. MetaWRAP实战深入binning

    Introduction 上一篇里通过Metabat2了解了宏基因组分箱的关键步骤,这篇文章将介绍一个更全面的binning流程:MetaWRA...

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    R绘制优美的进化树(进阶)

    上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法[//www.greatytc.com/p/b6c4d3376bc9],也埋下一个小坑:...

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    Slurm集群使用基础

    Introduction 我们在做生物信息分析时,对于大规模的上游数据的处理,一般需要在大型服务器或集群上进行。我最早接触并使用的是一个基于SL...

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    宏基因组分析流程(Metagenomic workflow)202405|持续更新

    Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量...

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    使用FastANI与Skani计算平均核苷酸一致性(ANI)

    Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性(Average Nucleotide Identity),它是一种用来比较两种基因组之间...

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    GTDB基因组分类数据库及GTDB-Tk工具

    Introduction GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个专注于基因组分类学的数据库,旨在提供高质量的细菌、古...

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    开发一个Rshiny应用(基础)

    Introduction Shiny 是一个 R 包,可轻松地直接从 R 构建交互式 Web 应用程序。还可以在网页上托管独立应用程序或将它们嵌...

个人介绍
生信博士生一枚,分享科研代码,经验。推文一般很长,努力将一个问题讲全面,感谢你的耐心阅读。