![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/16593252/001a7df9-26d0-46dc-95c6-fff1d3dd972c.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
我们关注蛋白质的功能,而结构和功能联系紧密。一旦在氨基酸序列水平发现有趣的序列(比如一个模体(motif)或者进化上保守的片段),下一步往往就是研究这段序列的3-D结构。(...
举个栗子🌰: 最近对拟南芥中的一个叫做CBF的基因非常感兴趣,现在我想看看这个CBF基因在一个新测序的物种Am基因组上是否存在,Am中有几个CBF基因?这样的查找可以通过本地...
18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
最近几期的文章介绍了一些辅助分子克隆实验的小工具,虽然功能很简单,还是费了很大功夫编写,最近确实很忙,不过趁周末终于把他们肝完了,本篇就对这些小工具做一个汇总,以暂时结束本系...
本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速度非常快,在我的Mac Pro就可以运行使用,而且其结果也比...
参考资料 https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 全基因组关联分析学习资料(GWAS tutorial) 论文 A tutoria...
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
按照前人的教程,跑了跑GWAS流程,作为初学者,欢迎大家提问,指教。 数据来源:A new regulator of seed size control in Arabido...
在实验室中,我们经常需要对分子生物学数据进行分析,常见的有DNA和蛋白质分子序列比对。分子序列比对分为全局序列比对和局部序列比对两种情况。其具体算法我们将在以后的文章中详细介...
前言 在工业界,天天做着重复的简单工作,已失去了对领域新技术发展的敏感性和好奇心,对技术人员来说这是件可怕的事情。因为没时间,也没兴趣看文献,不能掌握第一手资料,只能在网上找...
Part 1. 蛋白质组学中,谱图搜库是如何实现的? 蛋白质组学中,各种软件对质谱得到的谱图进行搜库时通常是利用以下三种方法之一进行: 根据相关的质量信息获得部分或完整的肽序...
官方文档: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准备 Spectronaut软件是蛋白组DIA...