是用as_matrix
R稀疏矩阵转化稠密矩阵|使用as.matrix()报错:Cholmod error 'problem too large'在进行一些数据分析是经常会需要将一个数据对象转化为矩阵,以及稀疏矩阵(sparse matrix)和稠密矩阵之间的互化。 问题&报错 在R环境中,用的非常普遍的函数就是as....
你好,请问迁移到D盘后,就成了ext4.vhdx,这样一个文件名的硬盘映像文件。那如果我要复制大文件到linux啥的,怎么用windows的文件管理系统操作呀!!!!拜托了
win11下Ubuntu子系统迁移D盘历程以及遇到的问题由于C盘快爆满,将子系统迁移至D盘。直接用系统自带的命令进行迁移。右键开始图标,打开Powershell。 输入以下命令: 显示你当前安装的子系统,我只有一个"Ubuntu"...
T 细胞(全部):CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef(效应T细胞): 辅助...
@纷纷不可诉 才看到回答,谢谢!
R稀疏矩阵转化稠密矩阵|使用as.matrix()报错:Cholmod error 'problem too large'在进行一些数据分析是经常会需要将一个数据对象转化为矩阵,以及稀疏矩阵(sparse matrix)和稠密矩阵之间的互化。 问题&报错 在R环境中,用的非常普遍的函数就是as....
你好,我跑到这一步一直出现这个报错。
> pbmc3k.final <- irGSEA.score(object = pbmc3k.final, assay = "RNA", slot = "data",
+ msigdb = T, species = "Homo sapiens", category = "H", geneid = "symbol",
+ method = c("AUCell", "UCell", "singscore", "ssgsea"), kcdf = 'Gaussian')
Validating object structure
Updating object slots
Ensuring keys are in the proper strucutre
Ensuring feature names don't have underscores or pipes
Object representation is consistent with the most current Seurat version
Calculate AUCell scores
Error in .AUCell_buildRankings(exprMat = exprMat, featureType = featureType, :
To use a dgCMatrix as input set 'splitByBlocks=TRUE'.
irGSEA:基于秩次的单细胞基因集富集分析整合框架(中文教程)一、背景 在单细胞转录组测序中,整合多样本数据进行分析逐渐成为一种趋势。越来越多的研究者趋于使用未校正批次效应后的数据进行差异基因分析。他们认为,校正批次效应后的数据,会掩盖...
您好,我发现这样处理后的矩阵都成了整数了,是要修改哪里吗
R稀疏矩阵转化稠密矩阵|使用as.matrix()报错:Cholmod error 'problem too large'在进行一些数据分析是经常会需要将一个数据对象转化为矩阵,以及稀疏矩阵(sparse matrix)和稠密矩阵之间的互化。 问题&报错 在R环境中,用的非常普遍的函数就是as....
Original 表观遗传学习小组 Epigenetics表观遗传学 本文根据 2016 年 8 月复旦大学倪挺教授在「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成,本文采用...
参考教程:微信公众号:生信星球批次效应处理实例:combat和removebatcheffect的对比 特别感谢:人美心善爱护小白的花花老师小洁忘了怎么分身 作为一个非常想搞...
step1 线性回归ROC与AUC的实现 这是计算affair的一个数据集 step2 绘图强大的一个包——pROC 虽然ROCR包可以满足我们的需要,但在功能上还是有些单一...