这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】:基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化:总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】:基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化:总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
1、fastq文件 一般我们从公司里得到的原始测序数据都是属于fastq.gz文件, .gz是一种压缩格式的缩写,于是首先第一步是对这些压缩格式进行解压操作 解压好的文件即正...
GO和KEGG富集分析是生物信息分析中常用的一种分析,针对不同的物种,大概整理了一下,我将其分成四类。 1. 人和小鼠等模式生物 最常用的就是clusterprofiler,...
RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因,然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。 1.水稻、小麦GO信息提取 在进行GO富集分析前首先要确定在你所使用的GO富集分析软件...
前面给大家简单介绍过☞什么是Gene Ontology(GO)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.co...
导读 gggenes: Draw Gene Arrow Maps in 'ggplot2'。 Github:gggens[https://github.com/wilkox/...
这一次,我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题,为什么要进行基因注释。就我目前而言,它用来解决如下问题: 在mapping-by-sequencing的时候,我找到了一些可...
本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程,通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图,喜欢的小伙伴欢迎关注,多多支持,原文链接:https://...
遇到了一个16S的课题,于是开始认真学习ASV和OTU的差别,顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物组领域最常见的研究手段。尽管鸟枪法测序可以为我们提供更高分辨...
写在前面 常做分子实验的小伙伴们,一定都离不开引物设计,其重要性我相信不用多说。而在我们设计引物的过程中,引物的特异性往往决定PCR的产物是否有杂带,从而影响下游实验,直接影...
相信不少人看过下面这个类型的故事,我把它稍作了个改编。超逸和艾斯发现有两个比自己来的晚的同事,山农和辛普森,都已升职加薪,而自己却一直原地不动。终于有一天,超逸忍不住了,冒着...
参考文章:1.//www.greatytc.com/p/c72bb359f050[//www.greatytc.com/p/c72bb359f050]2....
STAMP软件安装 软件官网http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMP 1. Microsoft Windows系统安装比较简单 2. ubun...
蛋白质的结构总览 1)氨基酸序列2)周期性的结构构象3)整条多肽链的三维空间结构4)多个亚基形成的复合体结构 蛋白质的二级结构 二级结构为蛋白质经过折叠,构成的规则的片段。 ...
来源https://www.sohu.com/a/164341318_732029 Top植物种的snoRNA基因数据库。 http://bioinf.scri.sari.a...