PASA[http://pasa.sourceforge.net/], acronym for Program to Assemble** S**pliced Alignme...
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我使用的maker版本为3.01.04 第一轮:将已知基因比对到基因组 包括两个部分:🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 1.(可选)构建自定义重复序列...
(全文5058字) 【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后,用组合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍体物种的基因组调查,用组合KMC+GenomeS...
Rehh包的使用 一、数据的输入 数据的输入格式有5种 1.标准单倍型格式,参考文件bta12_cgu.hap,使用less -S 命令查看 其中每行代表一个单倍型,每个单倍...
前情回顾 Seurat 4.0 ||单细胞数据分析工具箱有更新[//www.greatytc.com/p/48e4f61e3a84]Seurat 4.0 ||单细胞...
这部分直接从上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注释)[//www.greatytc.com/p/5d82acad6008]的数据而来,当然如果你上部分数据存...
该教程分为2部分,第1部分在:miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miRNA-预测新miRNA,到表达矩阵【一】 到此时,原始...
该教程分为2部分,第2部分在:miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miRNA-预测新miRNA,到表达矩阵【二】 因为之前碰到...
概念 FDR,Q value,adjust p valuep-value:衡量一次检验假阳性率的指标(False positive rate) ;q value:衡量错误发现...