seqyuan

作者：yuanzan链接：dyno使用教程--1个R包实现59种单细胞轨迹推断分析)来源：微信公众号著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 在上一期的《单细胞轨迹分析...

可爱的一只帆

看Cross-tissue organization of the fibroblast lineage的时候发现作者使用了Slingshot这个r包来做拟时序分析，尝试使用...

Davey1220

第八节：拟时序细胞轨迹推断 在本节教程中，我们将学习如何通过拟时序分析推断细胞分化轨迹。slingshot包可以对单细胞RNA-seq数据进行细胞分化谱系构建和伪时间推断，它...

名本无名

前言 分面的作用是在一个页面上自动放置多幅图像，它先将数据划分为多个不同的子集，然后分别将每个子数据集绘制到页面的小图形面板中。 ggplot2 有两种分面类型： 网格型 —...

Bio_Infor

前段时间一直在用cellranger count进行单细胞测序数据的处理，不得不说Cell Ranger作为10X Genomics官方的单细胞数据处理工具，功能还是很强大的...

生信编程日常

bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap，找到两者重合的区域。比如求两个peaks的交集，或者看很多...

Davey1220

Palantir是一种对单细胞测序数据进行分化发育轨迹推断的算法，于2019年发表在Nature Biotechnology上。Palantir将细胞分化模拟为一个随机的过程...

Hayley笔记

1. 数据下载 在读Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...