最近一直在用scanpy分析单细胞数据,真的是越用越顺手,但常在河边走哪有不湿鞋的呢?这不一不小心就给自己埋下了一个难以察觉的潜在问题。为什么这么说呢?因为这个问题通常情...
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最近一直在用scanpy分析单细胞数据,真的是越用越顺手,但常在河边走哪有不湿鞋的呢?这不一不小心就给自己埋下了一个难以察觉的潜在问题。为什么这么说呢?因为这个问题通常情...
有些问题来来回回,学了忘,忘了学,反反复复很多次,用到时依然是模糊的。之所以被遗忘,也许是问题本身不重要,没有什么存在感;也许是要学的东西很多,脑容量不够。Anyway,...
分析空间转录组数据的时候,简单地学习了一下MISTy模型框架:一个灵活扩展,可解释的机器学习框架,可用于从任何空间组学数据中提取关系,可同时评估数十到数千个marker。...
"枪响了""看到是谁开的枪了吗""看不清,他站在道德的制高点上,他在阳光下。" ——温特伯格《狩猎》 知其道,用其妙。 vect...
在RNA-seq分析结果中经常会看到由两个主成分(PC1,PC2)绘制的PCA (principal component analysis)质控图,来反映样本间的远近关系...
TCellSI:一款借助Mann-Whitney U统计量,通过特定marker基因集和背景基因,对T细胞状态进行评估打分的软件。该软件能够准确评估T细胞的八种不同状态分...
10x Visium空间转录组数据下游聚类时,可以分为两种策略:一是基于细胞类型相对比例聚类,二是基于基因表达值聚类。第二种与普通单细胞处理方法一致,第一种略有不同。 ...
Single-cell best practices学习资源所有内容如下: Introduction 1. Prior art[https://www.sc-best-pra...