每当需要做热图的时候，首先想到就是pheatmap。记不清啥时候第一次使用该包了，但从那以后这就是画热图的第一选择了，因为无论是功能，还是颜值，亦或是操作简易程度都可以算...
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每当需要做热图的时候，首先想到就是pheatmap。记不清啥时候第一次使用该包了，但从那以后这就是画热图的第一选择了，因为无论是功能，还是颜值，亦或是操作简易程度都可以算...
Seurat作为知名的单细胞数据分析框架，虽然很好用，但在大数据集一直存在速度上的短板，尤其在FindAllMarkers。所以其一直也在试图解决，比如通过引入featu...
虽然目前有很多语言模型可以替代人工写代码，但并不总是可以直接复制可用，有时候还是需要人工修改以完善可用。拥有学习能力，数据处理并没有会与不会，而是处理上的难易程度最终以花...
两分组的交集差集可视化最常用的方法就是韦恩图，复杂点如果分组超过5组可以换成upset图展示。虽然也是两分组，但如果有多个分类时韦恩图就不是好的选择了。此时，回到最简单的...
远程使用服务器资源的时候，运行任务通常都是提交给集群统一调度。但有时候也会选择本地化执行，如果这个任务需要运行很长的时间，一般会使用nohup命令将任务挂后台运行，这样即...
前面体验过presto包赋能Seurat在大数据集做差异分析的提升，详情见Seurat | 解决了FindAllMarkers在大数据集上的速度短板[https://mp...
一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
数据处理时经常需要做各种处理，如标准化和归一化，在R里面可以借助scale函数来轻松完成。默认情况下，该函数做的事情可以用下面的公式概括：其中 x 是原始数据点，μ 是数...
好看的图当然会锦上添花，单细胞美化的包很多，也各有特色，不妨收藏几个，方便以后事半功倍地画出漂亮的图。 scplotter[https://pwwang.github.io/...
