拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完,从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法,加起来也有二十余篇,按分析的流程整理出一份清单,也许以后有新的方法或者...
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转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类: 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析等image 无参考转录组序列...
Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture, 3C)技术,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个...
做完RNA-Seq测序之后,往往会用QPCR来验证一下结果。 因为RNA-Seq测序数据得到的结果作为定量参考,参数的改变也会造成结果的不同。所以需要进行qPCR验证,表达水...
什么?!按照转录组筛选的5个最明显的差异基因只有2个与qRT-PCR结果一致? 转录组测序(RNA-seq)将细胞内某一类型(或全部)的RNA逆转录成DNA,通过高通量测序的...
一般情况下,我们做完RNA-Seq后最简单的验证就是做个 qPCR对获得的差异基因进行验证。因此这是一条将生信分析文件提升到科学实验文章的捷径。 qPCR 概念 qPCR的全...
What are variants, alleles and haplotypes? What are variants? In the field of genetic v...
介绍 OrthoFinder 是一个快速、准确和全面的比较基因组学平台。 它找到正交群(orthogroups)和直系同源(orthologs),推断所有正交群的有根基因树,...
统计文件test.genome.fa,中每一条contig序列的长度、GC含量(GC占所有非N序列的比例)、重复序列含量(小写字母占所有非N序列的比例) 对scaffold和...
本次推送是文献分享29的对应内容。 Fig 1 基因组和比较基因组相关的文章中,最常放的一个图是对该物种和其他近缘物种以及外群构建系统发生树(Fig 1),用来研究物种的进化...
真菌遗传转化是将外源 DNA 传递和整合到真菌基因组上的生物学过程,利用该过程可改变靶标真菌的遗传学特性,研究其生物学功能。真菌遗传转化可通过多种方法实现,包括电转化,农杆菌...
使用devtools下载linkagemapview包 载入 数据类型类型介绍 mapthis 主要的文件类型(必须的),至少为三列,第一列为群组,第二列为位置,第三列为标记...
重测序技术简介 全基因组重测序(Resequencing)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。通过全基因组重测序,...