R刚入门的时候,能够正确读取单个文件就觉得小有成就,随着时间的积累,单一文件地读取已经不能满足需求了,此时,批量地做就是解放双手地过程。 使用for循环把下载地TCG...
R刚入门的时候,能够正确读取单个文件就觉得小有成就,随着时间的积累,单一文件地读取已经不能满足需求了,此时,批量地做就是解放双手地过程。 使用for循环把下载地TCG...
1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析,它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考:生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
三个月前R 4.0版本就已经正式上线了,之前怕麻烦就一直没更新,而现在由于要用到新版本的R包,才想起顺便一起更新了R。 目前在官网上的最新版R是2020-06-22的4.0....
list转化为data.frame 在数据处理过程中会遇到各式各样的要求,格式转换、数据结构重构等需求可以说是家常便饭了,所以R语言本身也提供了很多数据格式转换的函数或者...
一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
DepthOfCoverage会输出7个文本结果。其中一个是按照interval上的每个碱基,输出一行统计信息,所以会比较慢: .DepthOfCoverage.txt结果 ...
上一篇讲了GenVisR 基因组数据可视化实战 (一)[//www.greatytc.com/p/bb695b053246]是GenVisR画waterfall 图...
上次我们整理到bwa比对后得到bam文件,下一步我们要通过GATK流程从bam文件中call variant。一、使用GATK前须知事项: 对GATK的测试主要使用的是人类全...
首先是加载相关的包,mutate主要属于dplyr包里,这里我们统一使用tidyverse包。tidyverse包中含有各种数据整理以及画图的包,如下加载tidyverse包...