R语言数据分析指南

本节来介绍一个ggplot2的扩展包gggenomes使用它可以轻松地对不同来源的基因数据组合成一个全面而优雅的图，下面让我们来看一个小例子 安装R包 目前gggenomes...

大海龟啦啦啦

要使用HiC数据就会不可避免的要使用到HiC-Pro，但是HiC-Pro是一个比较难缠的软件，需要安装的东西比较多，会影响的东西比较多，因此我们使用conda建立一个新环境来...

大白菜的小猪猪

差异peaks分析是ATAC-seq下游分析中非常重要的一步，可以鉴定出不同样本之间开放程度不同的DARs（Different Accessible Regions），...

橙子_orange

1.将选中创建为一个名为chr15的object 前后 2.设置颜色和透明度整体透明度0.6：set sphere_transparency, 0.6单独设置object的透...

BINBINCC

基因表达量的衡量指标有：RPKM、FPKM、TPM。 RPKM：Reads Per Kilobase Million=Reads Per Kilobase Per Milli...

尐尐呅

十字花科是双子叶植物的一个大家族，包含了模式植物拟南芥及诸多含有遗传和形态高度多样的物种，具备较高的经济价值和科研价值。 为了帮助研究人员和育种人员在科学研究和育种应用中有效...

Hayley笔记

要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大约只有0.2pg。要把这么少的mR...