喜欢写代码的外科医生。
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htseq-count计数的相关内容前面在不同的学习阶段写过两次，分别是合并htseq-count的结果得到count matrix和htseq-count的一个坑，其中第二...
最近考种数据回来了，今年测得单株，本想用箱线图表示，后来一并把小提琴图也做了，顺便做个笔记吧。 利用SUMIF对相同rowname数据合并 首先遇到了一个问题，由于之前在收花...
生物信息学分析和作图是科研狗们的必备技能。近几年，随着数据类型的增多，excel、SPSS等常用软件已经不能满足科研需求了。R语言以其方便、快捷的优势，迅速获得许多编程技术不...
前言 论一个气场合适的导师的重要性。想起一个微信朋友前截图 A：导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，跟你牛不牛没有关系 B：你错啦，导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，很大程度上决定我牛不牛...
刘小泽写于19.3.19通常做富集分析时，我们会遇到两种方法Pathway和GSEA，它们到底有什么区别？ 前言 我们通过差异分析会得到一些差异基因，那么如何知道这些基因是做...
PCA（Principal Component Analysis）主成分分析， 用来考察多个变量间相关性一种多元统计方法，研究如何通过少数几个主成分来揭示多个变量间的内部结构...
前言 入了生物学的坑，狗狗们需要时不时的画一些图，看着别人高大上的图片，大家有没有好奇这些图片是怎么做出来的呢? 就本狗狗来看(狗狗可能来自农村-_-,)，现在铺天盖地的pa...
作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分析。然后把表达矩阵和分组信息分...
测序容易，解读困难 现在大部分同学做转录组实验都是让测序公司去分析，经过了那么多年的发展，公司提供的分析结果也是越来越丰富了，光结题报告就有几十页，结果文件有几百兆甚至超过1...
前面搜集了一些计算测序覆盖度和深度的方法，这次详细介绍下samtools如何解决了我的问题。 计算WGS/WES/panel捕获效率/覆盖度的方法有哪些：https://ww...
