xuzhougeng

一般基因组文章都会有下面这种酷炫图，用来描述基因组的基因密度分布，转座子的密度分布，和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系，以及其他各种你只要测序就能加上的信息，比如...

bio_橡树

网上主要有两种方法： bedtools 里的bamToFastqbamToFastq -i XX.bam -fq XX.fq samtools bam2fqbam2fq XX...

种菜的小王

写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...

生信云笔记

前言   对于用Linux来处理数据的用户来说，应该都知道Linux处理数据的三个强有力的命令awk、sed、grep——人称三剑客。那么今天想跟大家分享一个其中的一个命令a...

bcl_hx

注：图简单介绍 Proteomes：有三个物种，每个方框内的存在旁系同源(存在于一个物种中，因基因复制而被区分开，且功能发生改变)(图中体现为形状不一样)，不同方框之间存在直...

生信卷王

写在前面 以下内容均来自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班课堂笔记 1. Genome de nove 基础知...

xuzhougeng

谈论到直系同源基因分析的时候，大部分教程都是介绍OrthoMCL，这是2003年发表的一个工具，目前的引用次数已经达到了3000多，但这个软件似乎在2013年之后就不在更新，...