项目目的 CIRI2和CIRCexplore,2联合使用对数据进行circRNAs鉴定,并进一步做下游的差异表达等分析。 项目流程 1·tophat,BWA用于map到参考基...
IP属地:上海
项目目的 CIRI2和CIRCexplore,2联合使用对数据进行circRNAs鉴定,并进一步做下游的差异表达等分析。 项目流程 1·tophat,BWA用于map到参考基...
1.下载BWA 2. 解压缩 -j:有bz2属性的-x:解压;-v:显示所有过程 3. 编译BWA 4. 添加到环境变量 在bashrc文件末尾追加export PATH=$...
对于集合的可视化,第一时间想到的都是韦恩图(venn diagram),一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加,比如说五个的时候,你就很难从图中解...
理论知识: 组织是由不同谱系和亚型的细胞类型组成的复杂环境,每种细胞都有自己独特的转录组。因此,批量转录组分析是细胞类型特异性基因表达的总和加权的细胞类型比例在给定的样本。去...
这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
中游分析这个词是我杜撰的,用来强调表达矩阵构建过程并不简单。 0 前言 前几天Jimmy老师发了一篇 我用这个技能一杯咖啡的功夫就挣了800块钱,讲了他帮一个粉丝从公共数据库...
测序数据比对结果 BAM 文件用 samtools 进行 sort 之后发现体积变小了...当时怀疑是不是 sort 过程中有一部分 reads 被丢弃了?于是统计了一下原始...